Нашел таки решение для удаления сообщений на сервере при очистке корзины Mozilla Thunderbird. Сразу хочу сказать, что речь идет о работе с почтовым сервером по протоколу POP3.

Настройка параметров программы

Конечно, если возник вопрос удаления сообщений на сервере при очистке корзины Thunderbird, то эти настройки уже установлены, но все же.
Идем в «Просмотр параметров учетной записи», переходим в пункт «Параметры сервера». Ставим галку «Оставлять копии сообщений на сервере» и галку «Пока я не удалю их». Сохраняемся.

Читать далее Mozilla Thunderbird: удаление сообщений на сервере при очистке корзины →